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Journal of Thoracic Oncology

Cross-Validation Study for Epidermal Growth Factor Receptor and KRAS Mutation Detection in 74 Blinded Non-small Cell Lung Carcinoma Samples: A Total of 5550 Exons Sequenced by 15 Molecular French Laboratories

2.01
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juin 2011

Anatomo-pathologie, Biomarqueurs / Facteurs pronostiques et/ou prédictifs, Méthodologie / Essais thérapeutiques, Thérapeutique ciblée

En 2005, l’INCa a soutenu ce projet multicentrique ERMETIC (Evaluation of the EGFR Mutation status for the administration of EGFR-TKIs in NSCLC) dirigé par Jacques Cadranel et géré avec l’aide de l’IFCT dont le but était de progresser dans la standardisation du diagnostic moléculaire de mutations EGFR et KRAS. C’est la première partie de ce travail qui est présentée ici. Celle ci est partagée en 2 étapes : 1) études des éventuelles divergences entre échantillon inclus en paraffine et provenant de 74 patients et les échantillons congelés de ces mêmes malades examinés dans le laboratoire d’analyse moléculaire  de P Hainaut. 2)  comparaison des résultats des prélèvements inclus en paraffine provenant de 15 centres français de biologie moléculaires.

Comparés aux échantillons congelés examinés dans le laboratoire de référence, l’analyse des prélèvements inclus en paraffine n’a donné aucun faux positif et un très petit nombre de faux négatif. Ainsi les spécimens recueillis en paraffine représentent un bon matériel pour les recherches de mutations.

L’index de concordance entre les différents centres était variable meilleur pour la recherche de mutations de l’exon 19. Il dépend davantage de la qualité des prélèvements que des techniques de chaque laboratoire.

 

A suivre, la prochaine étape prospective menée par les mêmes équipes, où les biomarqueurs sont testés en situation réelle « de la vraie vie » souvent sur de petits échantillons contenant peu de cellules tumorales. 

Reference

Cross-Validation Study for Epidermal Growth Factor Receptor and KRAS Mutation Detection in 74 Blinded Non-small Cell Lung Carcinoma Samples: A Total of 5550 Exons Sequenced by 15 Molecular French Laboratories (Evaluation of the EGFR Mutation Status for the Administration of EGFR-TKIs in Non-Small Cell Lung Carcinoma [ERMETIC] Project-Part 1).

Beau-Faller M, Degeorges A, Rolland E, Mounawar M, Antoine M, Poulot V, Mauguen A, Barbu V, Coulet F, Prétet JL, Bièche I, Blons H, Boyer JC, Buisine MP, de Fraipont F, Lizard S, Olschwang S, Saulnier P, Prunier-Mirebeau D, Richard N, Danel C, Brambilla E, Chouaid C, Zalcman G, Hainaut P, Michiels S, Cadranel J.

J Thorac Oncol. 2011; 6 : 1006-1015.

Auteur

Bernard Milleron

Rédacteur en chef d'EM-Onco.